吳錫麒天姿超邁，吟詠至老不倦，能詩，尤工倚聲，詩筆清淡秀麗，古體有時藻采豐贍，代表作如《雙忠祠》、《鳳凰山懷古》、《觀夜潮》、《讀放翁集》等。在浙派詩人中，能繼朱（彝尊）、杭（世駿）、厲（鶚）之后，自成一家。亦能詞，但不如其詩和駢體文的著名。吳錫麒駢文頗著稱，吳鼒稱贊說：“不矜奇，不恃博，詞必澤于經史，體必準乎古初，……合漢魏六朝唐人為一爐冶之。”（《八家四六文鈔》）與邵齊燾、洪亮吉、劉星煒、袁枚、孫星衍、孔廣森、曾燠并稱駢文八家。晚年登門求詩者，絡繹不絕。 兼工書法，尤其擅長行書、楷書。代表作如《務本論》、《岳飛論》、《與袁簡齋前輩書》、《蘇文忠公詩合注序》、《湖心泛月記》等。吳錫麒的書法作品為中華人民共和國國家文物局公布為“精品和各時期代表作品不準出境者”。

　　著有《有正味齋集》73卷。凡詩集16卷，詩續集8卷，外集5卷；駢體文集24卷，駢體文續集8卷；詞集8卷，詞續集2卷，詞外集2卷。有嘉慶間刻本。另有《有正味齋文續集》、《有正味齋尺牘》、《有正味齋曲》、《有正味齋南北曲》、《有正味齋詩》、《有正味齋詩集》、《有正味齋賦稿》等。《藤花曲話》記吳錫麒所作南北曲，“亦復妙墨淋漓”。有《漁家傲》傳奇，演漢代嚴子陵故事，已佚。